Tomb Raider III začíná o několik miliónů let dříve, když se na zem zřítil meteorit. Meteorit se roztříštil na čtyři vzácné artefakty nadpřirozené moci. První lidé co je objevili byli Darwin a jeho námořníci, kteří tyto artefakty rozptýlili do celého světa. Později v současnosti, v Antarktidě, společnost RX Tech provádí výzkumy na místě, kde se onen meteorit zřítil.
Vedoucí firmy skot Dr. Willard, objeví mrtvolu Charlese Darwina a zjistí, že on a jeho námořníci prozkoumali nitro kráteru. Dr. Willard začal mít zvláštní posedlost dostat se do kráteru, a částí kde Darwinova posádka byla... a zemřela. Mezitím v Indii britská archeoložka Lara Croft pátrá po záhadném „Infada" artefaktu. Skutečně Lara, ale neměla ještě ani ponětí o skutečné síle tohoto artefaktu.
